Я думаю, вам будет очень тяжело с этим. Насколько я понимаю, стандарт WSDL 2.0 построен на XML 1.0. Итак, какую службу вы называете, которая описывает себя с помощью WSDL (при условии XML 1.0), а затем начинает отправлять вам сообщения с символами XML 1.1 в нем?
Когда вы определяете службу Axis2, вы можете определить, какие обработчики у нее есть в файле services.xml. Например, на этой странице у них есть служба, которая использует org.apache.axis2.receivers.RawXMLINOutMessageReceiver ... Я знаю, что это не то, что вы пытаетесь сделать, но, возможно, это место для начала смотреть или думать.