Установка стилей точек на Collapsed не решит вашу проблему, так как объекты все еще будут в визуальном дереве, влияющем на время рендеринга. Поскольку вы установили привязки для точек данных, единственный способ удалить их - это удалить ваши бизнес-объекты, с которыми они связаны.
Кроме того, поскольку вы говорите о производительности, стоит отметить, что производительность инструментария WPF намного ниже, чем у некоторых других бесплатных компонентов построения диаграмм. См. Эту статью о сравнении производительности компонента диаграммы - она была написана со сравнением версий Silverlight, но, по моему опыту, она применима и к WPF. Использование Visiblox, DD3 или Visifire, вероятно, значительно улучшит производительность ваших графиков. (Полное раскрытие: я принимал участие в разработке в Visiblox)