Это по многим причинам, но основной является mergeinfo.SVN не может отследить объединение информации о поддереве.Если вы попытаетесь это сделать, то в свойствах папки появится мусор.
Mergeinfo важна для правильной работы команды svn blame.
Если вы хотите зафиксировать только части папок, вы можетечто во время коммита.