Вы тестируете процесс установки ?
Если нет - все изменения в DesktopModules/YourModule или App_Code/YourModule вступят в силу немедленно и будут готовы к тестированию (при условии, что вы используете проект веб-сайта, а ваш виртуальный каталог указывает на вашего разработчика.каталог)
Если вы используете проект веб-приложения - внесите изменения, соберите, переместите файлы в целевую папку виртуального каталога, затем протестируйте.
Дайте мне знать, если это поможет.