Вы пытались использовать переключатель / passive или / quiet?
/ quiet - тихий режим (без взаимодействия с пользователем)
/ passive - автоматический режим (только индикатор выполнения)
/ q - установить уровень пользовательского интерфейса:
- n - нет пользовательского интерфейса
- b - базовый пользовательский интерфейс
- r - уменьшенный пользовательский интерфейс
- f - полныйUI
Попробуйте:
msiexec / x name_of_msi TRANSFORMS = name_of_mst / qn / quiet
или
msiexec / x name_of_msi TRANSFORMS = name_of_mst / qn / passive