Вы не можете решить эту проблему, не зная платформу вашего компьютера (где работает приложение) и удаленного компьютера.Но как только вы узнаете, что у вас много возможностей.
Полное решение агента
Установите агент на удаленной машине.Агент должен предоставить API, который разрешает доступ к файлам.Например, вы можете использовать FTP-сервер в качестве агента.Затем зайдите на этот сервер и загрузите ваши файлы.В качестве альтернативы вы можете реализовать свое собственное приложение или сервлет, работающий в одном из доступных контейнеров сервлетов, и предоставить доступ к файлам через HTTP.
Решение без агента
Использовать встроенныйв функциональности целевой машины.Например, используйте SSH для подключения к Unix-машине и SMB для Windows.Оба поддерживают Telnet. Вы можете использовать пакет VFS из Джакарты.Есть несколько реализаций SSH.Я рекомендую JSH.