Если спецификации файлов совпадают, можно использовать заголовок из первого файла и копировать оставшиеся файлы без их заголовка в один файл. Но спецификации должны точно совпадать по всем параметрам: от типа кодирования и параметров до количества аудиоканалов.
Если так, то все, что вам нужно сделать, это прочитать все файлы и пропустить первые xxx байты каждого файла, кроме первого.
Не будет работать, если VOB-файлы зашифрованы (шифрование DVD).
Примечание: это работа, которую специализированные инструменты делают хорошо. Они оптимизированы и (более или менее) без ошибок. Поэтому, если вы можете, используйте их (то есть из командной строки).