Я бы предложил сохранить конфигурацию запуска в общем файле в папке вашего проекта.Вы найдете эту опцию на вкладке «Общие» на скриншоте.
Если вы откроете ее с помощью текстового редактора, вы найдете следующие два тега
<stringAttribute key="org.eclipse.jdt.launching.PROGRAM_ARGUMENTS" value="YOUR PROGRAM ARGUMENTS"/>
<stringAttribute key="org.eclipse.jdt.launching.VM_ARGUMENTS" value="YOUR VM ARGUMENTS"/>
iТакже поделитесь конфигурацией запуска моих проектов в scm компании.