Вы можете настроить squid на прозрачный прокси.Это можно сделать в Linux, отредактировав правила IPTable.Таким образом весь трафик проходит через squid, который затем может войти в систему или делать что угодно.Кроме того, трафик не пропускается, но производительность будет снижена.