К сожалению, нет условного синтаксиса для условных комментариев, которые вы можете использовать в CSS. Условные комментарии являются расширением Microsoft для HTML, а не CSS.
Однако вы можете написать свой CSS-файл на PHP и заставить PHP использовать его в качестве CSS-файла.
Обратите внимание, что синтаксис вашего условного комментария для определения браузеров, не являющихся Internet Explorer, неверен. Вы хотите следующее:
<!--[if !IE]>-->
<style>
//code
</style>
<!--<![endif]-->
Это будет скрывать код между комментариями от IE.