Вы можете подавить пользовательские нарушения правил, используя SuppressMessageAttribute точно так же, как это делается для правил, которые поставляются как часть StyleCop. e.g.:
[SuppressMessage("Your.Analyzer.Namespace", "AA1000:RuleName")]
(где пространство имен, идентификатор правила и имя правила должны быть заменены фактическими значениями для правила)