Вы видите «файл не найден», потому что вы не указываете правильное имя файла, то есть:
"C:\\Program Files\\GnuWin32\\bin\\wget.exe http://www.youtube.com/get_video?video_id=... | ffmpeg -i - audio.mp3"
Выше не имя файла, это имя файла плюс некоторые аргументы, то естьзатем передается по каналу к другому исполняемому файлу.
Поскольку вы пытаетесь запустить здесь два исполняемых файла (wget и ffmpeg), подходом здесь будет написать скрипт (например, пакетный файл), который оборачивает эти два исполняемых вызова, а затемвыполнить скрипт и передать ему аргумент url.