Вам нужно использовать PuTTY, настроить в нем профиль для подключения к удаленному репозиторию.а затем в TortoiseHg вы можете подключиться к ssh: // profilename /
например, я установил один для bitbucket и назвал его bitb, поэтому соединение ssh: //bitb/url-to-repo.