Если вы не строите / не изменяете сам фреймворк, вам не нужно тестировать его модулем.
Что касается определяемых вами классов объектов юнит-тестирования, я бы порекомендовал следующее.
1. Создайте реализацию-заглушку, которая использует в базе данных памяти . Что позволит вам проверить взаимодействие класса.
2. Создайте свои классы таким образом, чтобы бизнес-логика не требовала Entity Framework, и тестируйте их напрямую.