Вы можете объединить JS в представление, как в обычную страницу .php.
Если страница вызывает постбэк, просто запустите таймер JS при загрузке страницы как обычно.
Если страница использует AJAX, поместите JS в представление содержимого. Затем попросите контроллер отправить сообщение, которое запускает таймер JS для обратного отсчета.
В противном случае я не совсем уверен, что вы спрашиваете.