все, что вам нужно сделать, это
1 - иметь копию папки yii framework
2 - создать новую папку yiic webapp
3 - загрузите обе папки, папка фреймворка может перейти в какое-то скрытое место yoursite.com/wawa/framework/yii, и вы можете просто загрузить файлы из папки веб-приложения на yoursite.com/
4 - отредактируйте файл index.php в созданном вами веб-приложении, чтобы он знал, где находится ваша папка framework / yii. чем вы настроены
5 - просто сделайте другую копию папки вашего веб-приложения, чтобы вам не нужно было создавать ее, если вы этого не хотите. просто используйте разные имена, без разницы, если webapp index.php знает, где находится ваша папка фреймворка, чем она будет работать