Я почти уверен (87%), что вы делаете это в Windows Explorer.
Я заметил, что если дважды щелкнуть файл .DOC в моем проекте, он запускает Microsoft Word. Аналогично, дважды щелкните файл .XLSX, и он запустит Excel.
Итак, зарегистрируйте .NTF как расширение, которое обрабатывает ваш инструмент. Затем, когда вы дважды щелкните файл .NTF в VS, он запустит ваш инструмент.