Некоторые из моих проектов - это просто коллекция небольших проектов (библиотек).Для их создания я создал простой файл pom.xml, который содержал каждую подпапку в виде модуля.У меня отлично работает.
В качестве альтернативы, вы можете использовать плагин M2 Extra Steps , чтобы вызывать все помпы по отдельности и при этом иметь удобную работу.Более простым был бы проект вольным стилем, здесь вы можете определить все другие цели.
У всех есть недостаток, заключающийся в том, что вам нужно явно настроить проекты.Если вы не хотите этого делать, напишите сценарий оболочки, который анализирует дерево каталогов и вызывает maven с найденными файлами pom.