Я хочу получить все входы, которые проверены и не скрыты
Это не работает:
.formyform input:checked:not(:hidden)
Есть ли простой способ сделать это?
Я не смог найти ни одного примера на сайте jQuery
То, что у вас есть, должно работать, хотя вы можете упростить это с помощью :visible:
:visible
.formyform input:checked:visible
Вы можете проверить это здесь .