Я предполагаю, что у вас есть анимация, содержащаяся в раскадровке, которая анимирует свойства TranslateTransform? В этом случае у вас есть два метода на раскадровке: Begin и Stop.
В этом случае самое простое решение вашей проблемы - вызвать Storyboard.Begin или Storyboard.Stop в обработчике событий Checkbox.Clicked.