Почему вы думаете, что это не будет?
Я не использовал JdbcTemplate
напрямую из Swing, но у меня есть несколько веб-приложений (у которых есть отдельный поток на запрос), и у меня никогда не возникало проблем с потоками из него. В этой ситуации шаблон настраивался один раз при запуске приложения и неоднократно вызывался с разными параметрами.
Если вы беспокоитесь о проблемах с многопоточностью, вы всегда можете создать новый шаблон для каждой цепочки ...