Похоже, что в этом случае обычный профилировщик может оказаться неподходящим инструментом, поскольку он ориентирован на измерение времени ЦП, затрачиваемого профилируемой программой, а не на внешние API, которые она вызывает, и они, как правило, вызывают высокиесвои собственные издержки и сбор большого количества данных, которые, вероятно, перегружат вашу систему, если оставить ее работать в течение длительного времени.
Если вам действительно необходимо собирать данные о производительности в течение такого длительного времени, и в основном для внешних вызовов, то Perf4J , вероятно, является лучшим инструментом.