Вы говорите о клиентском сертификате, который SharePoint будет использовать для аутентификации при подключении к какой-либо службе?Если это так, то вам нужно будет установить сертификат вместе с закрытым ключом.В противном случае, если вы просто говорите о корневом сертификате для проверки некоторого сертификата сервера в удаленной службе, вам не нужен закрытый ключ .
Предполагая, что вы имеете в виду сертификат клиента с частнымключ (я не знаю, как SharePoint использует сертификаты), тогда вам нужно будет установить сертификат вместе с закрытым ключом, а затем убедиться, что SharePoint имеет доступ к закрытому ключу.
Недостаточно простодля установки с закрытым ключом - вы должны либо установить, выполнив вход под учетной записью Windows, под которой будет выполняться код с использованием закрытого ключа, либо, если вы установите, например, сертификат в хранилище «Личный» на локальной машине, например,Вы должны установить ACL на сертификате, чтобы предоставить другой учетной записи Windows доступ к закрытому ключу.Для этого вы можете использовать инструмент WinHttpCertCfg.Ср здесь для общей идеи и здесь для загрузки инструмента.Или из оснастки «Сертификат MMC» выберите сертификат в «Локальный компьютер», «Личное хранилище», щелкните правой кнопкой мыши, выберите «Все задачи», «Управление личными ключами» и предоставьте доступ оттуда.