Создать файл / etc / mysql / conf.d / mysqld.cnf с содержанием:
[mysqld]
character-set-server = utf8
collation-server = utf8_unicode_ci
Если вы опустите collation-server , это должно бытьустановить utf8_general_ci .
Я протестировал эту конфигурацию с MySQL 5.6 в Ubuntu 15.04.