Во-первых, описание вашей проблемы немного неясно.Я не понимаю, хотите ли вы загрузить классы из файла jar для использования в вашем приложении, или файл jar содержит основной файл, который вы хотите запустить.Я предполагаю, что это второй.
Если так, у вас есть много вариантов здесь.Самым простым будет следующее:
String filePath; //where your jar is located.
Runtime.exec(" java -jar " + filepath);
Вуаля ... Если вам не нужно запускать файл jar, а просто загружать из него классы, дайте мне знать.