Большинство приложений .NET можно развернуть, скопировав сборки и файлы конфигурации.
Это относится и к unix / linux.
При использовании mono вам необходимо запустить приложение с помощью mono:
mono myapp.exe
Если вы говорите об «установщике», термин linux - «пакет», а упаковка для linux - большая и сложная тема.См. эту статью для понимания того, что в ней происходит.