То, что он имеет более высокий z-индекс, не означает, что он будет на вершине.Вы должны принять во внимание уровень стека родителей, и это становится контекстом стека.Попробуйте указать нестатическую (относительную) позицию для родителя 5000.
Если это не сработает, опубликуйте соответствующий HTML.