Насколько я знаю (и я попросил постоянного специалиста по репликации подтвердить это), вам нужно настроить новую статью / подписку при создании новой таблицы.SQL Server не будет автоматически добавлять новые таблицы для вас.
Возможно, вы сможете настроить триггер DDL, чтобы сделать это для вас, но, честно говоря, я не слишком разбираюсь в репликации, чтобы знать, возможно ли это илинет.