Основными факторами производительности по-прежнему будут дисковый ввод-вывод и размер базы данных, а не драйвер базы данных PHP.Какие бы там ни были различия, они будут минимальными.Но главная причина использования PDO заключается в том, что она делает вашу базу данных переносимой между различными бэкэндами.Если вы придерживаетесь команд SQL-92, вы можете легко перейти с SQLite на MySQL, MSSQL, PostgreSQL, Oracle и т. Д. И сохранить 99,9% существующего кода.