Eclipse работает с сетевого диска или файл, который вы редактируете на сетевом диске. Я запускаю Eclipse с PHPEclipse все время, и файлы, которые я редактирую, находятся на сетевом диске, который монтирует общий ресурс Samba на виртуальной машине Linux, и у меня нет проблем. Eclipse зависит от Java и также занимает много памяти. Возможно, вы захотите проверить, что Java работает правильно, и что у вас не хватает памяти. Или проведите эксперимент и отредактируйте файл, отсутствующий на сетевом диске, и посмотрите, не быстрее ли он.