Это зависит от того, что вы хотите сделать.IKVM работает лучше всего с .NET Framework от MS.С MONO на Windows это немного хуже.С MONO на Linux это еще хуже.
Я думаю, что многие будут работать на Monotouch.GUI может быть проблематичным.Я не проверял это.И я думаю, что это плохая идея.