Вы можете загрузить лист в Code Behind, как подсказывает @June, или вы можете загрузить его в сам aspx, используя встроенный код (некоторые недовольны, но поскольку файл CSS является логикой компоновки, я предпочитаю делать это таким образом)
Если вы всегда загружаете вторую таблицу стилей, просто если вы загружаете другую для каждого пользователя, вы можете написать что-то вроде этого внутри тега head вашей страницы aspx.
<link href="<%= the name of your style sheet %>" rel="stylesheet" type="text/css" />
если вы добавляете только таблицу стилей, вы можете написать это
<% if (whatever)
{ %>
<link href="style.css" rel="stylesheet" type="text/css" />
<%} %>