Это действительно другие закладки людей, о которых пользователь должен беспокоиться. Если он принадлежит ненадежному источнику, вы не знаете, что он может сделать при активации (кража файлов cookie или удаление конфиденциальной информации). Поскольку ваш код внедряется в межсайтовый сайт, реальной опасности для вас нет, и только для ваших пользователей если вы положите их там сознательно.
Edit:
Я бы избегал кода, который мог бы помешать глобальной области страницы хоста, например, переопределение глобальных объектов и прототипов. Вы можете поместить весь код вашей закладки в функциональный блок, чтобы ограничить его область действия:
(function(){
// your code
})()
Любые переменные и функции, определенные в этом блоке, не будут мешать странице хоста, если вы не окунетесь в глобальные объекты и прототипы, DOM и т. Д. Если вы опубликуете пример, где вам может понадобиться это сделать, мы могли бы помочь с рефакторингом.