Внутри вашего цикла WordPress просто добавьте эту оболочку.
if ( has_post_thumbnail() )
{
// run code for post
}
Так что ваш полный код, скорее всего, будет выглядеть примерно так.
if ( have_posts() )
{
while ( have_posts() )
{
the_post();
if ( has_post_thumbnail() )
{
// output html code for the post here
}
}
}