По моему опыту, невозможно измерить архитектуру, вооруженную такими цифрами, как эта. Я понимаю, что это все, что у вас есть сейчас, но я бы порекомендовал вам настроить один из ваших серверов, разместить там сервлет, который имитирует время транзакции, и использовать инструмент, такой как JMeter, чтобы увидеть, где он сломался.
Кстати, может быть много других узких мест - ваша база данных обрабатывает 400 транзакций в секунду?