Если вы все еще используете Visual Studio 2008, я не уверен, что вы сможете это сделать (хотя кто-то, пожалуйста, не стесняйтесь меня поправлять).
Но если выиспользуя VS2010, вы можете использовать новые параметры шаблонов T4 (даже при таргетинге на .net 3.5).Я бы сделал так, чтобы ваш базовый класс наследовал от класса EntityObject, а затем изменил шаблоны t4, используемые для генерации классов, наследуемых от вашего базового класса.
Если вы все еще в VS2008, вы, вероятно, можетепродолжая делать то же самое, вам нужно будет просто сгенерировать сгенерированные CS-файлы вручную (каждый раз, когда вы меняете модель), что будет ужасно.