Как сказали WhoSayln и Skilldrick, вы должны использовать ftp для загрузки файлов и удаления файлов с сервера (если у вас есть разрешение).
Но в своем вопросе вы говорите: «Я не могу удалить загруженные файлы с FTP». Вы хотите удалить локальные файлы с вашего компьютера (те, которые вы только что загрузили с FTP-сервера) или файлы с удаленного сервера?
Если локально, то просто rm -f file
сделает это: p
Но если он удаленный и работает по сценарию (типичное задание в пакете), попробуйте что-то вроде:
jyzuz@dev:/jean> ftp -n -i remoteserver.com << EOF
> user $username $password
> cd /remote/directory/
> rm filename.txt
> bye
> EOF
Больше или меньше? = Р