для обработки файлов вы можете обратиться к библиотеке apache.commons.io.
В ней есть встроенные вспомогательные функции для чтения и хранения файлов.
Так что для чтения
org.apache.commons.io.FileUtils#readFileToString(File file)
и для записи
org.apache.commons.io.FileUtils#writeStringToFile(File file, String data)
Смотрите здесь для javadoc http://commons.apache.org/io/