Обнаружили, что это происходит только тогда, когда скрипт запускается на диске, отличном от того, где находится EXE-файл. Чтобы обойти это, я просто перенес выполнение скриптов.
Очевидно, DLL относится к SSL, который не имеет отношения к тому, что я делаю, так что это подходящий обходной путь. Я предполагаю, что проблема вызвана изменениями в EXE для того, как он определяет относительные пути (как будто ничего не изменилось (AFAICT)) Или переменная среды% PATH% изменилась (более вероятно).
Надеюсь, это поможет кому-то в будущем.