Вы можете установить тайм-аут при запуске и завершении работы вашего сервера Tomcat в Eclipse. Если эти тайм-ауты превышены, Eclipse выдаст сообщение с вопросом, хотите ли вы его убить, или продолжайте ждать.
Чтобы установить их, дважды щелкните имя сервера на вкладке «Серверы». Откроется окно, подобное этому:
С правой стороны есть раздел Timeouts. Я установил запуск на один день (чтобы я мог отлаживать запуск без тайм-аута) и выключил до 30 секунд, чтобы быть щедрым (обычно это может быть очень коротким, поскольку большинство приложений могут пережить принудительное завершение без проблем).