С ui:include
идентификатор будет продублирован.
Вы можете передать параметр в ваш включенный xhtml и поставить префикс вашего идентификатора
<ui:include src="included.xhtml">
<ui:param name="idPrefix" value="myFormIdPrefix"/>
</ui:include>
В комплекте xhtml
<h:form id="#{idPrefix}_foo"/>
Теперь можно ссылаться на идентификатор как #{idPrefix}_foo