Согласно документации, вы используете предопределенные константы, чтобы установить размер вашего представления iAd. Эти константы обычно представляют ширину экрана и небольшую высоту, около 65 пикселей. Тогда может показаться, что iAd не совместим с UISplitViewController.
Я предлагаю взглянуть на документацию iAd AdBannerView . Это может помочь вам достичь того, что вы хотите. (Вы можете попробовать поместить iAd под splitviewcontroller, поскольку представление является представлением, независимо от того, подкласс это для uiviewcontroller.)