Несколько проходов означает выполнение нескольких пиксельных шейдеров, а также несколько операций ROP / смешивания, которые могут легко стать узким местом как на оборудовании последнего поколения, так и на оборудовании текущего поколения.
Таким образом, вставка всего в один проход или несколько проходов (C) должна быть выгодной.
Я не уверен насчет «объединить в FBO», хотя я не могу предоставить убедительных доказательств этого, похоже, что это будет медленнее (поскольку у вас будет как минимум 2 повторных FBO и, по крайней мере один трубопроводный киоск). Хотя, конечно, это зависит ... если вы объедините 17 одинаковых текстур один раз и нарисуете одну объединенную текстуру тысячу раз, это может быть быстрее. Если у вас есть дюжина или около того различных комбинаций того, как объединяются эти 17 текстур, это, вероятно, будет выглядеть по-другому.
Современные графические процессоры не должны иметь проблем с выборкой до 17 текстур в фрагментном шейдере (аппаратное обеспечение GL 3.x имеет минимум 48), и это просто.