Сначала попробуйте:
git difftool -t <yourtool>
Если это не сработает, посмотрите на man git-difftool
и проверьте список поддерживаемых инструментов.Проверьте, выполняет ли один из них то, что вам нужно, и если да, то вы сузили его до git, не поддерживающего Kaleidoscope, который может нуждаться в некоторой другой настройке конфигурации.