Я нашел этот пост, и он помог мне решить мою проблему.Хотя я хотел поделиться с IntelliJ чем-то конкретным, что может кого-то запутать.
Ниже я разместил картинку, где используется флаг -Duser.dir, а также заполнено текстовое поле Working Directory.
В этом случае для рабочего каталога будет задано значение «JarLearning», а не «2ndTry».