К сожалению, этот файл Microsoft.WebApplication.targets поставляется только с Visual Studio, а не с простым .NET SDK.
В принципе, должна быть возможность установить работающую Visual Studio и скопировать этот файл, однако, это не так просто, как копирование одного файла. По мере того, как вы копируете все больше и больше материала, вам становится интересно, где вы переходите от «исправления установки SDK» до «повторного создания установки Visual Studio» (и, следовательно, требует другой лицензии).
Таким образом, установка Visual Studio, по-видимому, является единственным способом создания проектов, для которых требуется Microsoft.WebApplication.targets. Не веб-проекты работают нормально.