Вы можете вставить симметричный ключ шифрования в свой двоичный файл, и этот двоичный файл будет считывать зашифрованное имя пользователя / пароль из файла на диске при запуске.
Тем не менее, это не намного больше, чем запутывание, поскольку ваш код, вероятно, будет где-то храниться в каком-то исходном хранилище.
Я бы посоветовал вам лучше контролировать физический и сетевой доступ к вашим серверам с помощью брандмауэра и пузыря частной сети и хранить пароли в открытом виде (или в кодировке base-64) на диске разрешения, заблокированные для запускаемого пользователя для вашего веб-приложения.
Вы также можете заблокировать сервер базы данных, чтобы принимать подключения только от компьютеров вашего веб-приложения по IP-адресу.
В конечном счете, ваша проблема в том, что ключ (ваша пара имя пользователя / пароль БД) должен быть доступен для программного, автоматического использования вашими веб-приложениями.