Вам не нужно настраивать область для каждой папки.
Если вы посмотрите на URL-адрес, используемый для поиска, при использовании «Этот сайт» и «Этот список», вы заметите, что для добавления в него параметра запроса «& u = URL-адрес сайта / списка» вы можете просто использовать это с URL-адресом папки