Что-то вроде этого должно делать то, что вы хотите:
RewriteRule ^([^/]*)/([^/]+)$ /$1
Вы также можете использовать $2
при перезаписи, если хотите сохранить последнее имя каталога в параметре или что-то еще. например:
RewriteRule ^([^/]*)/([^/]+)$ /$1?foo=$2
(Кроме того: я заметил, что под 3 каталогами вы на самом деле имеете в виду 2. Это первое, что является именем хоста, а не каталогом.)