Я давно не запускал phpBB, поэтому мой ответ условен:
- Если в этих файлах кеша есть реальный код PHP, то в APC стоит заняться кешированием. Я мог бы пойти еще дальше и сказать, что они невероятно полезны для кэширования, поскольку phpBB считает, что эти файлы будут использоваться достаточно часто, чтобы их стоило кэшировать.
- Если они содержат статический HTML или другой контент, не являющийся PHP, отфильтруйте их или убедите phpBB дать им альтернативное расширение.
Как быстро вы просматриваете свои данные в APC? Если вы перебираете кеш невероятно быстро, у вас проблема. Если бы количество пропусков оставалось постоянным и низким с течением времени, я бы об этом не беспокоился. Если вы храните много пользовательских данных в APC, это может быть способом сбить их. apc.php - отличный способ узнать больше о том, что задумал APC, но помните, что это дорогая страница для загрузки.
(работал на нескольких сайтах PHP, работающих с миллионами и десятками миллионов уникальных посетителей в день)